MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952308
2	NC_021847	AC	3	6	263	268	50 %	0 %	0 %	50 %	525952308
3	NC_021847	ATTG	2	8	308	315	25 %	50 %	25 %	0 %	525952308
4	NC_021847	TCA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952308
5	NC_021847	TA	3	6	334	339	50 %	50 %	0 %	0 %	525952308
6	NC_021847	AAGCA	2	10	556	565	60 %	0 %	20 %	20 %	525952309
7	NC_021847	AACCA	2	10	1528	1537	60 %	0 %	0 %	40 %	525952310
8	NC_021847	CAT	2	6	1539	1544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952310
9	NC_021847	ATG	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952310
10	NC_021847	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952311
11	NC_021847	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525952311
12	NC_021847	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	525952311
13	NC_021847	GT	3	6	1807	1812	0 %	50 %	50 %	0 %	525952311
14	NC_021847	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
15	NC_021847	ACA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
16	NC_021847	CAT	2	6	13915	13920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949894
17	NC_021847	AAG	2	6	13953	13958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949894
18	NC_021847	TTC	2	6	13964	13969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
19	NC_021847	CTT	2	6	14029	14034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
20	NC_021847	GAT	2	6	14044	14049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949894
21	NC_021847	GTA	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949894
22	NC_021847	TTA	2	6	14088	14093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949894
23	NC_021847	CT	3	6	14174	14179	0 %	50 %	0 %	50 %	525949894
24	NC_021847	ACG	2	6	14225	14230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949894
25	NC_021847	TTTA	2	8	14243	14250	25 %	75 %	0 %	0 %	525949894
26	NC_021847	TGT	2	6	14254	14259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949894
27	NC_021847	CTT	2	6	14308	14313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
28	NC_021847	TCA	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949894
29	NC_021847	AAT	2	6	14426	14431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949894
30	NC_021847	TCCA	2	8	14513	14520	25 %	25 %	0 %	50 %	525949894
31	NC_021847	CTT	2	6	14690	14695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
32	NC_021847	ATG	2	6	14698	14703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949895
33	NC_021847	CCA	2	6	14765	14770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
34	NC_021847	TCT	2	6	14782	14787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
35	NC_021847	C	7	7	14850	14856	0 %	0 %	0 %	100 %	525949895
36	NC_021847	TACC	2	8	14885	14892	25 %	25 %	0 %	50 %	525949895
37	NC_021847	GAGG	2	8	15017	15024	25 %	0 %	75 %	0 %	525949895
38	NC_021847	CA	3	6	15069	15074	50 %	0 %	0 %	50 %	525949895
39	NC_021847	GCT	2	6	15092	15097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
40	NC_021847	CAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949895
41	NC_021847	TTGG	2	8	15189	15196	0 %	50 %	50 %	0 %	525949895
42	NC_021847	ATAA	2	8	15292	15299	75 %	25 %	0 %	0 %	525949895
43	NC_021847	CCAA	2	8	15333	15340	50 %	0 %	0 %	50 %	525949895
44	NC_021847	CAC	2	6	15347	15352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
45	NC_021847	ACGG	2	8	15368	15375	25 %	0 %	50 %	25 %	525949895
46	NC_021847	GT	3	6	15446	15451	0 %	50 %	50 %	0 %	525949895
47	NC_021847	T	6	6	15533	15538	0 %	100 %	0 %	0 %	525949895
48	NC_021847	TCA	2	6	15559	15564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949895
49	NC_021847	ACC	3	9	15609	15617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
50	NC_021847	CCAA	2	8	15634	15641	50 %	0 %	0 %	50 %	525949895
51	NC_021847	CAT	2	6	15695	15700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949895
52	NC_021847	GGA	2	6	15706	15711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949895
53	NC_021847	GTT	2	6	15721	15726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949895
54	NC_021847	GTAA	2	8	15740	15747	50 %	25 %	25 %	0 %	525949895
55	NC_021847	TCT	2	6	15769	15774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
56	NC_021847	CG	3	6	15819	15824	0 %	0 %	50 %	50 %	525949895
57	NC_021847	TCT	2	6	15851	15856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
58	NC_021847	CTT	2	6	15872	15877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
59	NC_021847	CTG	2	6	15935	15940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
60	NC_021847	CGT	2	6	16032	16037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
61	NC_021847	GCCA	2	8	16087	16094	25 %	0 %	25 %	50 %	525949895
62	NC_021847	TAA	2	6	16106	16111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949895
63	NC_021847	ATAC	2	8	16206	16213	50 %	25 %	0 %	25 %	525949895
64	NC_021847	GCC	2	6	16251	16256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949895
65	NC_021847	T	7	7	16311	16317	0 %	100 %	0 %	0 %	525949895
66	NC_021847	CGTT	2	8	16321	16328	0 %	50 %	25 %	25 %	525949895
67	NC_021847	TAA	2	6	16438	16443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949896
68	NC_021847	CTT	2	6	16474	16479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
69	NC_021847	CAA	2	6	16486	16491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
70	NC_021847	CAC	2	6	16534	16539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
71	NC_021847	TG	3	6	16713	16718	0 %	50 %	50 %	0 %	525949896
72	NC_021847	AAC	2	6	16737	16742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
73	NC_021847	ATG	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
74	NC_021847	TAT	2	6	16837	16842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
75	NC_021847	TTG	2	6	16866	16871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
76	NC_021847	CTT	2	6	16900	16905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
77	NC_021847	AAG	2	6	16920	16925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
78	NC_021847	ACC	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
79	NC_021847	CTT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
80	NC_021847	ACCA	2	8	17060	17067	50 %	0 %	0 %	50 %	525949896
81	NC_021847	TCT	2	6	17092	17097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
82	NC_021847	CAA	2	6	17110	17115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
83	NC_021847	CCA	2	6	17158	17163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
84	NC_021847	CA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	0 %	50 %	525949896
85	NC_021847	TGGT	2	8	17378	17385	0 %	50 %	50 %	0 %	525949896
86	NC_021847	TGTT	2	8	17493	17500	0 %	75 %	25 %	0 %	525949896
87	NC_021847	AGA	2	6	17564	17569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
88	NC_021847	TTC	2	6	17609	17614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
89	NC_021847	AGA	2	6	17713	17718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
90	NC_021847	CAA	2	6	17851	17856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
91	NC_021847	TGA	2	6	17857	17862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
92	NC_021847	AAC	2	6	17910	17915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
93	NC_021847	CTT	2	6	17941	17946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
94	NC_021847	ATG	2	6	17997	18002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
95	NC_021847	GCT	2	6	18039	18044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949896
96	NC_021847	GCC	2	6	18060	18065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949896
97	NC_021847	CAAG	2	8	18111	18118	50 %	0 %	25 %	25 %	525949896
98	NC_021847	TGC	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949896
99	NC_021847	TTG	2	6	18146	18151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
100	NC_021847	TTG	2	6	18164	18169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
101	NC_021847	GGA	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949896
102	NC_021847	ATT	2	6	18212	18217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
103	NC_021847	TTG	2	6	18404	18409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949897
104	NC_021847	GGC	2	6	18437	18442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949897
105	NC_021847	TTC	2	6	18464	18469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949897
106	NC_021847	ACC	2	6	18497	18502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949897
107	NC_021847	CAA	2	6	18520	18525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949897
108	NC_021847	CTT	2	6	18535	18540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949897
109	NC_021847	AAT	2	6	18554	18559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949897
110	NC_021847	CAA	2	6	18565	18570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949897
111	NC_021847	AAG	2	6	18790	18795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949898
112	NC_021847	GAAA	2	8	18829	18836	75 %	0 %	25 %	0 %	525949898
113	NC_021847	CCA	2	6	18868	18873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949898
114	NC_021847	GCCA	2	8	18918	18925	25 %	0 %	25 %	50 %	525949898
115	NC_021847	TGT	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949898
116	NC_021847	TCA	2	6	19039	19044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949898
117	NC_021847	GTA	2	6	19152	19157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949898
118	NC_021847	TCT	2	6	19287	19292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949898
119	NC_021847	AGA	2	6	19350	19355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949898
120	NC_021847	CAAC	2	8	19642	19649	50 %	0 %	0 %	50 %	525949899
121	NC_021847	TGC	2	6	19661	19666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949899
122	NC_021847	TCA	2	6	19675	19680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949899
123	NC_021847	GAC	2	6	19994	19999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949900
124	NC_021847	CAA	2	6	20111	20116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949900
125	NC_021847	CTT	2	6	20127	20132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949900
126	NC_021847	GCAA	2	8	20173	20180	50 %	0 %	25 %	25 %	525949900
127	NC_021847	ATC	2	6	20209	20214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949900
128	NC_021847	CAC	2	6	20264	20269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949900
129	NC_021847	GCG	2	6	20333	20338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949900
130	NC_021847	TTTC	2	8	20351	20358	0 %	75 %	0 %	25 %	525949900
131	NC_021847	CG	3	6	20386	20391	0 %	0 %	50 %	50 %	525949900
132	NC_021847	GCC	2	6	20412	20417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949900
133	NC_021847	CGAT	2	8	20429	20436	25 %	25 %	25 %	25 %	525949900
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157	NC_021847	TGG	2	6	21943	21948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949902
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259	NC_021847	ACC	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949907
260	NC_021847	TCT	2	6	28067	28072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949907
261	NC_021847	CAGA	2	8	28098	28105	50 %	0 %	25 %	25 %	525949907
262	NC_021847	ACC	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949907
263	NC_021847	AGTG	2	8	28271	28278	25 %	25 %	50 %	0 %	525949907
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265	NC_021847	CA	3	6	28788	28793	50 %	0 %	0 %	50 %	525949908
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271	NC_021847	CATTG	2	10	29312	29321	20 %	40 %	20 %	20 %	525949908
272	NC_021847	GT	3	6	29383	29388	0 %	50 %	50 %	0 %	525949908
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371	NC_021847	ACA	2	6	35119	35124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949915
372	NC_021847	CGT	2	6	35126	35131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949915
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380	NC_021847	CTT	2	6	35642	35647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
381	NC_021847	TTC	2	6	35664	35669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
382	NC_021847	CTT	2	6	35721	35726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
383	NC_021847	AAC	2	6	35775	35780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949916
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385	NC_021847	GCC	3	9	35829	35837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949916
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387	NC_021847	CTT	2	6	35906	35911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949916
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